Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
IFT140Q96RY7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT140Q96RY7 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms