Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBGCP5Q96RT8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms