Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms