Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HIC2Q96JB3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms