Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms