Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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RNF185Q96GF1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RNF185Q96GF1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RNF185Q96GF1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RNF185Q96GF1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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RNF185Q96GF1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RNF185Q96GF1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RNF185Q96GF1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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RNF185Q96GF1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RNF185Q96GF1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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