Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms