Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP13Q92995 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP13Q92995 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP13Q92995 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP13Q92995 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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