Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDAQ92838 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDAQ92838 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EDAQ92838 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDAQ92838 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDAQ92838 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDAQ92838 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EDAQ92838 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EDAQ92838 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EDAQ92838 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms