Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GIPC3Q8TF64 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GIPC3Q8TF64 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GIPC3Q8TF64 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GIPC3Q8TF64 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GIPC3Q8TF64 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GIPC3Q8TF64 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GIPC3Q8TF64 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GIPC3Q8TF64 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GIPC3Q8TF64 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms