Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

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Length 1,954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHD5Q8TDI0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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