Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms