Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF248Q8NDW4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ZNF248Q8NDW4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF248Q8NDW4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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