Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HACD2Q6Y1H2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms