Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMIGD1Q6UXZ0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms