Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms