Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATG16L1Q676U5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms