Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBAP2Q5T6F2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBAP2Q5T6F2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms