Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PERM1Q5SV97 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms