Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BRMS1LQ5PSV4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms