Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PCID2Q5JVF3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms