Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PKDCCQ504Y2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms