Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBPF1Q3BBV0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms