Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EDRF1Q3B7T1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms