Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSPP1Q1MSJ5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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