Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MSMPQ1L6U9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms