Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KNOP1Q1ED39 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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