Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RTL8BQ17RB0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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RTL8BQ17RB0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RTL8BQ17RB0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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