Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LAMA3Q16787 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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LAMA3Q16787 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LAMA3Q16787 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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