Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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NRF1Q16656 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NRF1Q16656 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NRF1Q16656 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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NRF1Q16656 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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