Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACKR1Q16570 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms