Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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