Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCN9AQ15858 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCN9AQ15858 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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