Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NEDD8Q15843 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NEDD8Q15843 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms