Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ALX1Q15699 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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