Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP10Q15642 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP10Q15642 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms