Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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