Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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NCF4Q15080 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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