Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NFIXQ14938 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFIXQ14938 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms