Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IHHQ14623 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IHHQ14623 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms