Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL4A6Q14031 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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COL4A6Q14031 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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COL4A6Q14031 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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COL4A6Q14031 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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COL4A6Q14031 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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COL4A6Q14031 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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COL4A6Q14031 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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COL4A6Q14031 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL4A6Q14031 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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