Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HTR4Q13639 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HTR4Q13639 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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