Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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CUL3Q13618 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CUL3Q13618 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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