Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BFSP2Q13515 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms