Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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FOXE3Q13461 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXE3Q13461 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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