Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SKP2Q13309 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SKP2Q13309 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SKP2Q13309 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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