Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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CBX3Q13185 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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CBX3Q13185 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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CBX3Q13185 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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CBX3Q13185 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CBX3Q13185 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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