Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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