Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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IFT88Q13099 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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IFT88Q13099 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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IFT88Q13099 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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IFT88Q13099 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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IFT88Q13099 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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IFT88Q13099 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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IFT88Q13099 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFT88Q13099 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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