Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK2Q13002 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
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